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Médecine de Précision

Les plateformes OMICS4 génèrent les données multi-omics nécessaires à la stratification des patients et à la validation de biomarqueurs, réservables et prêtes pour l'audit à chaque étape.

Aperçu

Des données de cohorte, produites sous un seul protocole

OMICS4 produit les données derrière les études de stratification : génomiques, transcriptomiques et protéiques, à partir de sang, de FFPE et de tissu congelé. Les collectes multi-sites sont consolidées en un lot unique, traité sous une seule chaîne de traçabilité.

Plateaux

Les plateaux mobilisés par une étude de cohorte

Génomique

Exome, panels ciblés et génome entier sur la cohorte.

  • Préparation de librairies NGS
  • Séquençage de l'exome et du génome entier
  • Panels ciblés sur un jeu de gènes défini
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Transcriptomique

Profilage d'expression bulk et cellule unique.

  • RNA-seq bulk sur la cohorte
  • Cellule unique quand le plan l'exige
  • Sorties quantifiées quand le service le couvre
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Protéomique

Panels protéiques pour une mesure orthogonale.

  • Panels protéiques ciblés
  • Western blot en interne
  • Spectrométrie de masse via notre réseau
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Extraction & contrôle qualité

Un protocole documenté appliqué à chaque échantillon.

  • Sang, plasma, FFPE et tissu congelé
  • Concentration, pureté et intégrité mesurées
  • Un rapport QC sur chaque échantillon
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Les échantillons acceptés

Sang total, plasma, blocs et lames FFPE, tissu congelé et acides nucléiques extraits. Les critères sont publiés par type d'échantillon, pour l'ADN comme pour l'ARN, FFPE compris.

Cohortes et contrôle des lots

Les collectes arrivant de plusieurs centres sont consolidées en un lot unique enregistré, pour qu'une différence entre centres ne devienne pas une différence entre courses. Une cohorte qui s'inclut dans le temps est traitée lot par lot sous le même protocole documenté, avec la composition des lots consignée pour pouvoir en tenir compte à l'analyse.

Ce que vous recevez

Un rapport QC pour chaque échantillon. Les fichiers de séquençage et, quand le service le couvre, les sorties alignées et quantifiées. Des tableaux de résultats pour la PCR et le travail protéique. Des exports dans les formats que votre équipe importe déjà, et des délais publiés par service.

Où s'arrête la paillasse

L'analyse, l'intégration, la découverte de biomarqueurs et la modélisation ne font pas partie d'une réservation de plateau. Elles sont assurées par l'équipe computationnelle de GenXMap. Demandez-les dans la demande de devis, les deux sont cadrés ensemble.

L'analyse chez GenXMap

Un projet dans ce domaine ?

Dites-nous la taille de la cohorte, les types d'échantillon et le calendrier.

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