Consignes de soumission des échantillons
Notre portefeuille couvre la génomique, la transcriptomique, la métagénomique, l'épigénomique, le séquençage cellule unique, le génotypage et plus encore. Un acide nucléique de qualité en entrée est ce qui rend possible des données de qualité en sortie. Ces consignes couvrent le conditionnement, l'étiquetage, l'expédition et les exigences minimales d'échantillon pour chaque service, afin que votre projet démarre du bon pied.
Les échantillons nous parviennent pseudonymisés : nous recevons un code, jamais l'identité d'un patient. Les données sont hébergées dans l'Espace économique européen, et GENXMAP dispose d'un addendum d'hébergement de données de santé avec son hébergeur, certifié HDS par BSI, pour les projets qui le requièrent.
Les exigences détaillées sont présentées sur quatre pages dédiées, une par famille d'échantillons. La PCR quantitative et la protéomique sont traitées plus bas sur cette page.
Quantité minimale, concentration, pureté et intégrité pour le séquençage de génome entier et d'exome, les panels ciblés, les plateformes à…
Quantité minimale, concentration, RIN et pureté pour le RNA-seq bulk, les petits ARN, la cellule unique et le spatial. Y compris ce que nous…
Comment conditionner, étiqueter et envoyer vos échantillons pour qu'ils arrivent dans l'état où ils sont partis : envois sous carboglace ou à…
Sang, tissu frais ou congelé, blocs FFPE, salive, écouvillons, selles, culture cellulaire : comment prélever, stabiliser et conserver chacun, et…
Plateforme PCR quantitative & Génotypage
Couvre la plateforme PCR quantitative & Génotypage : qPCR, PCR digitale (dPCR), génotypage SNP/CNV et tests de détection de pathogènes. La préparation d'échantillon est plus légère qu'un séquençage complet, et le délai est rapide.
Pour les quantités d'échantillon de génotypage SSR et typage HLA, voir le tableau de séquençage ADN ci-dessus, car ces tests partagent le même format de soumission.
Plateforme Protéomique
Notre plateforme Protéomique couvre le Western blot en interne et les panels de biomarqueurs, ainsi que la protéomique par spectrométrie de masse réalisée via notre réseau de partenaires spécialisés.
Vous ne savez pas quelle quantité d'échantillon vous avez vs. dont vous avez besoin ? Indiquez-nous votre type d'échantillon et nous confirmerons l'entrée exacte avant que vous n'expédiiez quoi que ce soit.
Vous ne savez pas quel service vous convient ?