Industries · Maladies Infectieuses & Microbiome
Les plateformes OMICS4 combinent transcriptomique hôte et profilage du microbiome pour aider les chercheurs à comprendre les interactions hôte-pathogène et la dynamique des communautés microbiennes, réservables et prêtes pour l'audit à chaque étape.
Plateformes mobilisées
Aperçu
OMICS4 réalise le séquençage derrière les études en maladies infectieuses : transcriptome de l'hôte, 16S et métagénomique shotgun, à partir de matrices où une extraction standard sous-performe. La biosécurité et le confinement sont cadrés à la réception, pas une fois les échantillons arrivés.
Plateaux
Séquençage 16S et shotgun de la communauté microbienne.
Séquençage ARN de l'hôte depuis la même collecte.
Acides nucléiques extraits de matrices difficiles.
Détection ciblée et mesure de charge.
Écouvillons, selles, biopsies, sang, isolats, biofilms et échantillons environnementaux. Ce sont les matrices où une extraction standard sous-performe, donc le protocole est choisi par matrice plutôt qu'appliqué comme un standard unique. Les protocoles de collecte sont publiés par type d'échantillon, et les critères ADN s'appliquent après extraction.
La logistique des échantillons et leur manipulation au laboratoire sont cadrées sur vos exigences de biosécurité et de confinement dès la réception, avant tout envoi. Une partie de nos laboratoires se trouve au bâtiment Méditerranée Infection à Marseille, l'un des principaux instituts européens de recherche en maladies infectieuses.
Un rapport QC pour chaque échantillon. Les fichiers de séquençage et, quand le service le couvre, les sorties alignées et quantifiées. Des tableaux de résultats pour la PCR et le travail protéique. Des exports dans les formats que votre équipe importe déjà, et des délais publiés par service.
L'analyse, l'intégration, la découverte de biomarqueurs et la modélisation ne font pas partie d'une réservation de plateau. Elles sont assurées par l'équipe computationnelle de GenXMap. Demandez-les dans la demande de devis, les deux sont cadrés ensemble.
L'analyse chez GenXMapUn projet dans ce domaine ?